王理
王理
发布时间:
2020-12-01
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1703

王理(兼),教授、博士生生导师,校智能信息技术研究中心数字医学团队PI。在学术与产业界从事医疗领域的AI与大数据等领域方面的教学与科研工作。先后主持或参加国家级,省部级以及市厅级研究课题共计13项,包括国家自然科学基金面上项目和科技部重点专项子课题。在国内外期刊上发表近100篇论文,其中以第一作者(并列)发表论SCI论文12篇,EI论文9篇。影响因子合计>35,参加国内外学术交流26次,参与国外3部专著编写与出版,科研成果获省部级奖2项。参与获得中华预防医学会科学技术奖三等奖一项,江苏省科技进步奖三等奖一项,江苏预防医学科技奖一等奖一项,江苏省卫生厅医学新技术引进奖一等奖一项,南通市科学技术进步奖二等奖一项,南通市青年科技奖等。目前是江苏省第十批“六大人才高峰”资助对象,江苏省计算机协会大数据专家委员会委员,OHDSI(The Observational Health Data Sciences and Informatics)中国工作组委员


联系方式:QQ同微信,49344920

邮箱: wangli@ntu.edu.cn


教育经历:

2008.4–2011.3日本德岛大学

专业:智能信息系统工程(自然语言处理)学历:博士

2003.9–2006.6南京师范大学

专业:教育技术学历:硕士

1999.9–2003.6南京师范大学

专业:教育技术学历:学士


工作经历:

2021.07-至今    南通大学,智能信息技术中心智慧医疗方向PI,教授,博士生导师

2019.08-2021.06 南通大学,智能信息技术中心智慧医疗方向PI,校聘教授,博士生导师

2012.08-2019.07 南通大学医学院医学信息学系,副教授,硕士生导师

2016.8-2017.2 美国德克萨斯大学休斯顿健康科学中心, 生物信息学院,访问学者

2012.6-2014.6南通大学附属医院南京医科大学,博士后

2011.6-2012.7南通大学, 医学院医学信息学系,讲师

2006.7-2007.12江苏工程职业技术学院,信息系,讲师


研究方向:

主要专注于医疗大数据的管理和挖掘,涉及到自然语言处理技术,机器学习技术和深度学习技术,创建中国首个临床药物标准知识库,在国际组织OHDSI上推广应用。研究目标是提高医疗数据效率,改善数据互操作的准确性和可用性,从而支持医学研究和医疗数据的应用。目前担任多家医学信息公司的技术总监与顾问,具有丰富的医疗信息行业产业化经验。


主持横向产学研课题

·苏州赫博特医疗信息科技有限公司,临床电子病历中命名实体的抽取技术改进,2017/10-2018/10,6万元,提前结题(负责电子病历中命名实体识别技术改进)

参与开发Plato医学自然语言处理平台,实现将电子病例中大量存在的由自由文本描述的主诉、既往史、现病史、检验、检查、入院记录、出院小结、病程等非结构化信息,转化成统一化、规范化、结构化编码的数据,并且对接到OMOP临床科研通用数据模型,解决非结构化数据转化为标准的结构化数据难题,打破文本数据和临床科研分析之间的屏障。目前,平台中包含多种赫博特拥有完全自主知识产权的自然语言处理技术和功能模块,使用者可以根据文本的类型自由配置我们提供的算法来生成各种管道模型,能快速的实现文本的精准提取,准确率可达到90%以上。


·神州数码医疗科技股份有限公司,肿瘤大数据处理分析与应用,2017/12-2018/11,60万元,在研(负责国家癌症中心肿瘤电子病历的规范化存储)

收集肺癌、食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌等8 种常见等恶性肿瘤的临床电子病历文本,结合病理科和检验科以及医嘱文本,建设标准化和可共享的病历文本集成平台;利用自然语言处理和电子病历信息抽取等关键技术进行大规模数据抽取。实现肿瘤大数据高性能处理分析与具体应用。

整合SNOMET CT,CHPO,LOINC等多个术语系统,开发针对肺癌、食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌等8 种常见等恶性肿瘤的专用术语体系,协助进行电子病例的结构化和数据提取。对癌症知识,采用本体技术进行研究和分析,构建癌症本体模型。协助建立肿瘤医疗随访平台,临床决策支持平台。优化肿瘤精准医学大数据存储技术及传输安全性。


主持或参加纵向项目(课题)及人才计划项目情况

·国家自然科学基金,面上项目,面向信息交互的中国临床标准药物知识库构建与评测研究, 57万(直接经费),在研,2018-2022,主持

为了使得不同系统之间能够有效地无歧义地交换药品相关信息,项目通过借鉴国外成熟的药物信息模型,针对中国临床药物的描述特点,构建中国临床标准药物知识库。研究从四大数据源搜集药物的基本信息,然后将自然语言处理技术和领域专家审查相结合,实现药物属性提取,标准化,生成不同规格级别的药物名称描述,从多角度多层次构成药物知识库。目前药物知识库包含19,639种临床药物,250,267条药物概念以及2,602,760条药物关系。我们将药物知识库应用于江苏省人民医院院内药品与药物知

识库进行映射、转换成通用数据模型中标准概念,用于后期药物统计与数据挖掘。实验结果表明,药物知识库可以准确描述规范化的药物信息,覆盖大部分药物资源,展示其促进中国各种电子病历系统之间药物信息互操作性的能力。


·科技部国家重点研发计划,基于人工智能的临床辅助决策支持新型服务模式解决方案,总经费3800万(国家分拨经费800万,个人负责研究经费80万),在研,2018-2020,核心参与人员

建立临床文本中辅助决策支持概念的标准化映射,将临床指南转化为临床知识库体系;

基于多种决策支持模型的新一代人工智能技术实现,搭建满足就医闭环流程需求临床辅助决策专家系统大数据云技术平台。研究临床医学文本的存储、管理与分析智能化流程,尤其是解决实现多中心临床数据的高速传输、云端管理与分析完整流程;在统一数据标准化框架下,开发临床辅助决策专家系统;研发新一代人工智能计算框架、算法与模型,实现知识的排列,索引与展现;分析满足智能辅助分诊、问诊、诊断和治疗的多致病性因素的分布规律。


代表性论文:


[1]Li Wang, Yaoyun Zhang, Min Jiang, Jingqi Wang, Jiancheng Dong, Yun Liu, Cui Tao, Guoqian Jiang, Yi Zhou, Hua Xu:Toward a normalized clinical drug knowledge base in China - applying the RxNorm model to Chinese clinical drugs. JAMIA JOURNAL OF AMERICAN MEDICAL INFORMATICS ASSOCIATION 25(7): 809-818 (2018),(IF4.2 JCR2区)


[2] Wang L, Pan LH, Yao M, Cai Y, Dong ZZ, Yao DF. Expression of oncofetal antigen glypican-3 associates significantly with poor prognosis in HBV-related hepatocellular carcinoma. Oncotarget. doi: 10.18632/oncotarget.9892. 2016,7(27):42150-42158(SCI2015 = 5.008) JCR1


[3]Yao M#, Wang L#, Yang JL#, Yan XD, Cai Y, Yao DF. IGF-I receptor as an emerging potential molecular-targeted for hepatocellular carcinoma in vitro and in vivo. Tumour Biol. doi:10.1007/s13277-016-5296-3.1-10 (SCI2015 = 2.926) JCR3


[4]Wang L, Yao M, Pan LH, Qian Q, Yao DF. Glypican-3 is a biomarker and a therapeutic target of hepatocellular carcinoma. Hepatobiliary Pancreat Dis Int. 2015, 14(4): 361-366. (SCI =1.724)


[5] Wang L, Yao M, Zhang YP, Qian DM, Geng XY, Jiang K, Dong JC. Building Chinese field association knowledge base from Wikipedia. Int. J. Computer Applications in Technology. 2015, 52(2/3):168-176. (EI)


[6] Wang L, Zhang YP, Qian DM, Yao M. Extract Information from Public Health Emergency Web Documents, International Conference on Information Technology and Artificial Intelligence, Jinan, China, April 2015,765-770. (EI)


[7] Yao M#, Wang L#, Qiu LW, Qian Q, Yao DF. Encouraging microRNA-Based Therapeutic Strategies for Hepatocellular Carcinoma. Anticancer Agents Med Chem. 2015, 15(4): 453-460. (SCI = 2.722)


[8] Wang L, Yao M, Dong Z, Zhang Y, Yao D. Circulating specific biomarkers in diagnosis of hepatocellular carcinoma and its metastasis monitoring. Tumor Biol. 2014, 35(1):9-20. (SCI = 3.611) JCR3


[9]Yao M#, Wang L#, Dong ZZ, Yu DD, Qian Q, Shi Y, Wang SY, Yao DF. Glypican-3 as an emerging molecular-target for hepatocellular carcinoma gene therapy. TumorBiol, 2014, 35(6): 5857-5868. (SCI = 3.611) JCR3


[10]Wang L, Yao M, Yan MJ, Gu X, Yan XD, Yao DF. Silencing hypoxia-inducible factor-1α gene transcription on effects of human hepG2 cell proliferation and angiogenesis factors. J Pure ApplMicrobio, 2013, 7(S): 461-467. (SCI=0.073)


[11] Wang L, Yao M, Zhang YP, Geng XY, Qian DM, Jiang K, Dong JC. A Rule-Based Algorithm for Extracting Medical Data from Text, International Symposium on Signal Processing, Biomedical Engineering, and Informatics (SPBEI 2013), Hangzhou, China, December 2013:185-193. (CPCI-S)


[12] Wang L, Zhang YP, Qian DM, Yao M, Dong JC, Yao DF. Extract Examining Data Using Medical Field Association Knowledge Base, Proceedings of 2012 5th International Symposium on IT in Medicine and Education (ITME 2013), Xining, China, July 2013:2189-2193. (EI)


[13] Zhang YP, Jiang K, Dong JC, Qian DM, Wu HQ, Geng XY, Wang L*. Negation Detection in Chinese Electronic Medical Record Based on Rules and Word Co-occurrence, Proceedings of 2012 5th, International Symposium on IT in Medicine and Education (ITME 2013), Xining, China, July 2013:2215-2200. (EI)


[14] Yao NH#, Yao DF, Wang L#, Dong ZZ, Wu W, Qiu LW, Yan XD, Yu DD, Chen J, Sai WL, Zhang HJ, Yang JL. Inhibition of autocrine IGF-II on effect of human HepG2 cell proliferation and angiogenesis factor expression. Tumor Biol. 2012; 33: 1767-1776. (SCI=2.518)JCR3


[15] Wang L, Jiang K, Geng XY, Zhang YP, Zhou D, Dong JC. A New Method for Document Classification Using Field Association Knowledge Base, 2012 IEEE 2nd International Conference on Cloud Computing and Intelligence Systems, Hangzhou, China, October 2012:1885-1890. (EI)


[16] Wang L, Fuketa M, Morita K, Aoe J. Context Constraint Disambiguation of Word

Semantics by Field Association Schemes. Inform Process Manag. 2011, 47(4):560-574. (SCI=1.119) JCR4


[17]Li S#, Yao D, Wang L#, Wu W, Qiu L, Yao M, Yao N, Zhang H, Yu D, Ni Q. Expression characteristics of hypoxia-inducible factor-1α and its clinical values in diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma. Hepat Mon. 2011,11(10): 821-828. (SCI=2.19)


[18] Wang L, Yao DF, Yao NH, Yu DD. Abnormal expression of IGF-II in HBV-related liver diseases and influences of activation intervention on prolification of HepG2 cells. Int J Infect Dis. 2011, 15(1),s67. (SCI=1.938) JCR3


[19] Wang L, Atlam E-S, Fuketa M, Morita K, Aoe J. A New Method for Solving Context Ambiguities Using Field Association Knowledge, Proceedings of the 6th International Conference on Natural Language Processing and Knowledge Engineering (IEEE NLP-KE'10), Beijing, August 2010:41-46. (Best paper, EI)


[20] Wang L, Yata S, Atlam E-S, Fuketa M, Morita K, Bando H, Aoe J. A Method of Building Chinese Field Association Knowledge from Wikipedia, Proceedings of the 5th International Conference on Natural Language Processing and Knowledge Engineering (IEEE NLP-KE'09), Dalian, September 2009:569-572. (EI)


[1]王理*,张远鹏,董建成.利用领域关联知识从电子病历中抽取检查数据.中华医院管理杂志,2014,30(3):210-213. (北大核心)


[2] 张远鹏,董建成,钱旦敏,蒋葵,陈亚兰,王理*. 中文电子病历否定术语检出方法研究. 生物医学工程学杂志. 2015, 32(1): 93-96. (北大核心)

[3]张远鹏,董建成,钱旦敏,耿兴云,吴辉群,王理*,医院门户网站门诊专家信息的抽取研究,生物医学工程学杂志,2015,32(6):1249-1254.(北大核心)


[4]张远鹏,王理*,董建成. 基于规则和词共现的中文电子病历否定检出. 计算机应用与软件. 2015, 32(3): 50-52. (北大核心)


[5]王理,肖水凤,姚敏,蒋葵,董建成. 基于CiteSpace的医学信息学研究热点可视化分析.中国数字医学. 2015, 10(10):27-29. (中文核心)


[6] 王理,姚敏,顾星,时运,邱历伟,陆少林,姚登福.下调缺氧诱导因子-1α表达对肝癌细胞增殖和凋亡的影响.世界华人消化杂志, 2013, 21(28): 2937-2944. (中文核心)


论著之外的代表性研究成果和学术奖励

(1) 王理(3/8), 新型癌胚型特异标志和HBV变异对肝癌监测和早期预警价值, 中华预防医学会,中华预防医学会科学技术奖三等奖, 科技进步, 其他, 2017.11

(姚登福; 曹广文; 王理; 张津玮; 陈建荣; 姚敏; 董志珍; 吴玮) (科研奖励)

(2) 王理(2/7), 肝癌分泌型聚集素异常表达及其靶向干预的临床价值, 南通市人民政府,南通市科学技术进步奖三等奖, 科技进步, 其他, 2017.5

(郑文杰; 王理; 陈飞; 赛文莉; 钱琦; 姚登福; 张海健) (科研奖励)

(3) 王理(4/5), 流感病毒感染诱发多脏器损伤及线粒体能量代谢障碍机制, 江苏省教育厅,江苏省教育科学研究成果(高校科学技术研究类)科技进步奖二等奖, 科技进步, 其他, 201(姚登兵; 姚敏; 蔡敏; 王理; 姚登福) (科研奖励)

(4) 王理(4/7), HBV相关肝癌发病机制及特异分子监测技术研发与应用, 江苏省人民政府,江苏省科学技术奖三等奖, 科技进步, 其他, 2015

(姚登福; 曹广文; 王进科; 王理; 张津玮; 姚敏; 朱建伟) (科研奖励)

(5) 王理(2/7), 肝癌IGF-I受体异常表达及其转录干预的临床价值研究, 南通市人民政府,南通市科学技术进步奖二等奖, 科技进步, 其他, 2015.12.21

(董志珍; 王理; 姚登福; 李敏; 姚宁华; 严晓娣; 吴玮) (科研奖励)

(6) 王理(4/9), 肝细胞恶性转化特异标志筛选及早期预警价值研究, 江苏省预防医学会,江苏预防医学科技奖一等奖, 科技进步, 其他, 2015.2.27

(姚登福; 王进科; 龚伟达; 王理; 张津玮; 顾红兵; 徐水珠; 朱建伟; 陈钟)

(7) 王理; 邵劲松; 蓝俊; 施维; 薛均; 张远鹏; 董建成; 姚敏; 姚登福, 一种突发公共卫生事件互联网文本抽取方法, 2015.12.23, 中国, CN201510964759.6 (专利)

(8) 王理; 蓝俊; 邵劲松; 施维; 薛均; 张远鹏; 董建成; 姚敏; 姚登福, 一种公共卫生事件预警知识库的构建方法, 2015.12.22, 中国, CN201510961363.6 (专利)

(9) 王理; 张远鹏; 钱旦敏; 董建成; 姚敏; 邵劲松; 蓝俊,一种领域知识库属性扩展的方法, 2015.1.8, 中国, CN201510010013.1 (专利)

(10) 王理; 张远鹏; 钱旦敏; 姚敏; 邵劲松; 蓝俊; 董建成,一种公共卫生突发事件领域知识库的构建方法, 2015.1.8, 中国, CN201510009769.4 (专利)